采用本研究构建的数学模型，用MALDI-TOF MS鉴定甲氧西林敏感（MSSA）与抗性(MRSA)金黄色葡萄球的实验程序和相应的操作。
1.仪器
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS）、培养箱、高压灭菌器、生物安全柜、离心机、移液器、振荡器。
注意：因该分析模型时间基于ClinProTools软件构建的，该软件是布鲁克公司开发并仅适用于布鲁克质谱产生的原始数据，因此需要使用布鲁克MALDI-TOF MS系列质谱，并配有ClinProTools 分析软件。
2. 试剂耗材
（1）仪器校正标准品：可采用大肠埃希菌、不同型号厂家自带校正品，市售校正品进行仪器校正，校正质量范围为2,000-20,000Da。
（2）基质：-氰基-4-羟基肉桂酸（CHCA）。
（3）试剂：色谱级乙醇、甲酸、三氟乙酸、乙腈；18兆欧超纯水；
（4）耗材：1.5ml离心管，接种环，废液缸，吸头（10μl、200μl、1ml）。
3. 试剂配制
（1）基质溶解液：超纯水与乙腈按1:1的比例混合，加入三氟乙酸（TFA），使其在溶液中的浓度为2.5%，现用现配。
（2）基质饱和溶液：按需取相应体积的基质溶解液，多次少量加入基质粉末，每次加入后均震荡溶解，直到基质不再溶解后停止加入基质；2000g离心，上清备用。
（3）70%甲酸提取液：根据使用量，采用超纯水与甲酸配制成70%的甲酸溶液，现用现配。
4. 检测模块安装
将本项目开发的金黄色葡萄球菌MRSA/MSSA检测模块拷贝到任意目录下。
5. 检测流程
（1）菌株培养：按金黄色葡萄球菌的培养要求培养。
（2）样本制备：为确保生物安全及鉴定效率，不提倡直接涂抹法，建议使用乙醇/甲酸提取法进行样本制备；应在生物安全柜中进行样本制备。
用接种环刮取单菌落或按需刮取适量的菌胎；将刮取的病原菌，置于含有200μl超纯水的离心管中，混匀；加入600μl的乙醇，混匀；12000g离心2分钟，弃掉上清；沉淀中加入50μl 70%的甲酸溶液，混匀，加入50μl乙腈，混匀；12000g离心2分钟，取上清备用。
注意：可根据菌量调整超纯水与乙醇的使用体积，但需保证两者的体积比为1:3；可根据沉淀量调整70%的甲酸和乙腈的使用体积，但需保证两者的体积比为1:1。
（3）点靶：用移液器吸取1μl制备的样本溶液，点到质谱样本靶上，室温自然干燥；吸取饱和基质溶液1μl覆盖到靶板上的样本点上，室温自然干燥。
（4）质谱检测：将样本靶放入质谱中，根据各自使用的仪器型号调整参数，检测范围为2000-20000 Da，采集数据，确保谱图累计叠加峰强度在10000以上，并保存到相应的自定义文件中。
6. 结果检索及判读
打开ClinProTools软件，将本研究开发的检测模型调入软件，采用Classify功能，调入采集的待分析原始数据，点击确定进行分析，结果列表中1代表MRSA，2代表MSSA。